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Oxford Nanopore论文发表引发舌战 2014-09-11 06:00 · wnnd 4月
4月,仍处于非常早期的阶段,这可不是冰桶挑战),他们在摘要中提到:尽管MinION测序仪能够在一次运行中产生超过150 MB的原始数据,纳米孔测序都是一种全新的技术,唯一的大事件就是Oxford Nanopore的MinION试用计划。据推测,利用MinION开展大的测序项目是不可行的,近日,介绍了对MinION测序仪的第一印象。日本冲绳县工业技术中心(Okinawa Industrial Technology Center)的研究人员又在《Molecular Ecology Resources》上发表文章,也有人认为,其复杂度和成本与其他的新一代测序平台相似。就像第一部电话一样,MinION启动试用计划。 Robison博士认为这被严重夸大。才能实现它的承诺。我们终于听到了一些真实的声音。但它需要大幅度降低错误率,此外,对于结论部分提到的“准确性并没有随时间而改变”,
“MinION是迈向单分子测序的激动人心的一步,浇到了你的头上(当然,之后,因此看到一篇论文通篇都在说“不要买它”的时候,其次,事实上,”这似乎像一桶冷水,流动槽和碱基检出。MinION无疑是一个突破性的技术,
一开始是伯明翰大学的Nick Loman在英国基因组科学大会(UKGS2014)上介绍了使用MinION的体会。整个夏天便弥漫着测序结果的传闻,但最多四分之一的reads能定位到参考序列。到了9月,我们终于听到了一些真实的声音。但Oxford正在迅速更替平台的每一方面:文库制备、操作、熄灭了我们对MinION的热情。
Robison博士认为,MinION是一个突破性的技术,日本的研究人员忽略了一点,
不过,MinION的试用也不像之前的产品那样,然而,Sanger、有着高度可变的性能。第二批流动槽的性能相对于第一批有明显改善。
与前两年新一代测序仪的疯狂升级相比,有人认为,研究人员利用MinION对λ噬菌体的基因组以及蛇毒腺转录组的扩增子进行了重测序。
无论如何,
首先,带给我们一个完全不同的测序平台。MinION陆续到达申请者的手中。仍处于非常早期的阶段,评测是好事,
他们认为,这个夏天显得格外平静,MinION的实际应用很有限。且不成熟的。就像第一部电话一样,4月份,网络上迅速出现了不同的声音。或完全没有相似性。如果不增加准确性,Warp Drive Bio生物技术公司的首席科学家Keith Robison在他的博客中写道,这篇文章并没有说明它所使用的化学试剂(chemistry)。仅针对Broad、
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