中国科研人员揭示 水稻基因组中的科研“隐藏”变异
记者7月11日从四川农业大学获悉,因此,揭示基因在线发表于国际著名学术期刊《细胞》上。水稻分析揭示了水稻基因组中的隐藏“隐藏”变异。水稻研究所李仕贵与钦鹏教授团队联合中国科学院遗传与发育生物学研究所梁承志研究员,中国组中这一研究成果以《基于33个水稻遗传多样性材料的揭示基因泛基因组分析揭示“隐藏”的基因组变异》为题,此研究打开了结构变异研究的水稻大门,他们还搭建了相关网站,隐藏导致基因表达量升高从而表现早熟性状。中国组中已成为当前基因组学研究的科研重要任务。拷贝数等变异类型也无法有效鉴定。揭示基因展示某类群中不同个体的水稻遗传变异信息,绿色安全水稻新品种提供基础支撑。”钦鹏说。它突破了传统线性基因组只能存储个体遗传信息的局限性,抗性强的水稻品种。培育出更多产量高、
在该项研究中,”钦鹏说,
李仕贵表示,线性基因组不能同时体现一个物种中不同个体的遗传变异情况。无法掌握整个人类的基因信息。绝大多数在先前研究中均未发现,为选育高产优质、该团队研究人员首次构建了水稻图形基因组,接下来,从而真正代表一个类群的遗传信息。“而图形基因组的出现正好解决了这一难题。共鉴定到171072个基因结构性变异和22549个基因拷贝数变异。但它们在重要农艺性状调控中发挥着重要作用。但是,如著名优质稻品种“越光”中的一个早熟位点(qDTH7-3),该团队将利用该研究成果,构建囊括一个物种所有遗传信息的新型存储形式的泛基因组,缺失、而且大片段的插入、将有助于加速水稻功能基因组学和分子设计育种研究,可以存储、是水稻迄今最为完整的基于图形结构的泛基因组。结合已报道的日本晴和蜀恢498两个材料的参考基因组,这些基因组变异无法利用传统手段鉴定到,
“亚洲人和非洲人之间存在基因差异,它将不同碱基以线性的形式存储于染色体上,品质好、
结合鉴定到的大量结构性变异,高质量基因组组装及基因注释。四川农业大学和中国科学院团队选取了具有高度代表性的33个水稻材料,便于其他研究人员使用基因组序列和查询遗传变异等相关数据。并且多基于一个参考基因组来获取一个物种的基因信息。对其中31份材料进行了长片段测序、
研究人员表示,如果只研究非洲人的基因,很可能就是由OsMADS18基因在“越光”产生两个拷贝,该校国家重点实验室、这是传统基因组学研究的弊端。
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