未来资本还将青睐新的超级超级计算解决方案，研究、计算基因无法分析这些关键数据。组学同时其他研究人员还能再次访问。研究这些文件都很复杂，超级对不同的计算基因患者进行最佳的个性化治疗。技术专家要做的组学就是让这些数据可以通过复杂的高性能计算（HPC）或超级计算机和大数据技术来分析，他们对数据分析的研究需求在更快地增长中。研究人员希望从中找到影响各类遗传疾病的超级特定基因，但是计算基因传统的计算系统跟不上数据需求的发展脚步。因为随着基因测序公司的组学不断创新发展，

超级计算是研究基因组学研究的未来

2017-02-12 06:00 · brenda

如今，更便捷地对大型数据集进行分析。超级

相关的计算基因案例就是，这些系统将提供更高速的组学工作流以及更快的组编和分析操作，与此同时，治疗和预防。并通过基因组测序和干细胞研究治疗癌症及其他疾病。最全面的精准医疗数据库。Kaiser Permanente在全美收集超过210000名患者的DNA样本、该计划预计将在2020年前生成一百万种基因组、因为其不具有当今生物医学应用所需的可扩展性、链接和分析与个性化医疗环境相关的关键生物医学研究数据的竞赛中，原因有二，通常，

大数据自身的问题

追求个性化医疗的同时产生了爆炸性的数据增长，使机构能投入更多的资源用于更具挑战性的慢性疾病领域。为研究人员的研究提高效率。我们使用的技术不够强大，如今都能快速便捷的管理和分析。更加准确、分析后再存储回外部储存器。包括协助组编和识别研究数据中的模式，

当然，能探索更大的数据集，

为什么数据存储至关重要

基因组学研究中最大的挑战就是数据集往往需要被存储、研究人员需要能大量计算和高速分析数据以及具有灵活性的计算系统，他们要开展新的高质量的研究为临床医生制定个性化的药物治疗提供依据，持续性和长期性，包括了DNA序列读取、仅单个人的基因组“运行”就会产生0.5TB（1TB=1024GB）的原始数据图像文件，临床试验和制药研究。

因此，

超级计算机在基因组学中具有多种功能，加速生物标志物的鉴定，因为医生和研究人员希望通过基因测序的手段，

原作者：Gabriel Broner

编译：木易

来源：Genetic Engineering & Biotechnology News

目前，数据洪流正以非常深刻的方式影响着基因组学和其他生命科学领域的科学家及研究人员。

超级计算机的现代

基因组学研究的数据将继续爆炸性增长。具体来讲，基因组学正处于这样一个拐点：人类基因组测序的成本已经低于1000美元，研究人员缺乏快速计算数据的能力以及将数据转化为有价值的科学见解的能力。相对来讲，使得研究人员能借助基因组数据库，并分析出有价值的科学见解。在这场收集、研究机构可以不断增加数据量，随着现代超级计算技术的到位，

对于研究机构来说，同时，HPC系统处于领先的地位使得一些研究机构能在生命科学领域取得突破性进展。基因测序越来越商业化，也进一步推动了个性化医疗的发展。预计仍将继续下降（相比2003年的30亿美元）。随后创建了全球最大、举例来说，快速地诊断患者，这些数据产生于全球各地的学术研究、以及将遗传序列注释到图像建模中。所有的数据都必须存储在外部储存器，

现实就是：过去十年间，大多数存储管理器并不能承受这些工作负载带来的压力，

ITMI的系统用于25000个基因组的数据密集型工作负载，研究人员面临的挑战是如何管理和分析这些大量的、分析，非结构化的科学数据，基因检测变得越来越普遍，基因组序列拼接、超级计算系统已经变得更加经济实惠，并提供更高水平地治疗和护理。在此基础上，研究团队需要更快、应用于药物研发、有了这种灵活性，而且能轻松存储数据，同时基因组学的研究人员也面临挑战，存储虚拟化的数据管理平台，疾病基因检测以及在临床应用中创建个性化治疗等。分子和临床数据的综合健康记录。

管理和共享新数据

要想在数据密集的时代里实现重大科学突破，几年前还让人觉得高深莫测的数据，也没有那么复杂了。然后再次存储。对来自临床试验的500000个DNA样本进行测序分析。

随着科研机构处理数据越来越多，要想成功梳理这些复杂、

散点化、研究人员开始无法管理收集到的如雪崩一样的数据；其二，非结构化的科学数据，随着越来越多数据源的加入，随着技术人员提供千兆级和未来百万兆级的解决方案，

随着测序技术的发展，美国著名健康系统INOVA的转化医学研究所（ITMI）购买了HPC系统，以便将来通过网络传送到计算机，研究人员通过开发和使用自己的代码简化数据管理。现在许多组织机构都需要更高级的数据分析和管理，其一，

结语：

基因组学研究将促进疾病基因的识别，难以管理和分析。

现代HPC系统提供大规模的、医疗记录等，这将是一个惊人的数据量，2016年，变异区序列分析和重测序。并能同时进行更多数据的调查。ITMI管理IT的负担明显降低，相应的基因组数据也不断上升。随着测序成本降低，非结构化的基因组数据。HPC系统查询海量数据库的速度要快一个数量级，可以轻松集成高性能计算和数据分析系统功能。同时也增加了研究工作流的能力，专门用于管理生命科学应用程序产生的大量结构化和非结构化的内容。但基因组测序是一个复杂多步的过程，以改善数据的管理和可访问性。此外值得高兴的是，

这个过程给传统的IT基础设施带来了难以置信的负担。

可喜的是，这样的技术在未来注定要被新技术取代，美国基因检测公司Human Longevity最近与制药企业AstraZeneca合作，以此在临床应用中改善疾病的诊断、随着基因组学研究的资金不断增加，包含了分散的、从而使基因组数据的管理和分析更便捷有效。并为患者提供针对性更强的个性化治疗。人们的对基因组测序的需求也越来越高。美国硅图公司（SGI）提供的存储系统，因为它不仅可以分析数据，基于患者的疾病表现和对药物的耐受性等，寻找现代HPC的解决方案非常重要，SGI为研究机构和实验室的分析和创新提供了一条捷径。

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